16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4545 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4545  phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 335 aa  686    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0996613  normal  0.214352 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3244  hypothetical protein  52.46 
 
 		 316 aa  287  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.214234 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3456  phosphoribosyltransferase  51.58 
 
 		 316 aa  279  6e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.807464  normal  0.52603 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3722  hypothetical protein  51.58 
 
 		 316 aa  278  7e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3246  hypothetical protein  47.73 
 
 		 319 aa  275  9e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.422901 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3720  hypothetical protein  50.17 
 
 		 317 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.675827  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3454  hypothetical protein  50.52 
 
 		 317 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0133767  normal  0.531245 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29940  Phosphoribosyltransferase protein  38.7 
 
 		 321 aa  183  4.0000000000000006e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.245931  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0322  phosphoribosyltransferse  27.27 
 
 		 272 aa  100  4e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.27724  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0033  amidophosphoribosyltransferase  31.68 
 
 		 497 aa  44.7  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0004  amidophosphoribosyltransferase  34.34 
 
 		 493 aa  44.3  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.645305  normal  0.0907172 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2736  amidophosphoribosyltransferase  31.65 
 
 		 502 aa  44.3  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2226  amidophosphoribosyltransferase  31.65 
 
 		 502 aa  44.3  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.467921  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1448  amidophosphoribosyltransferase  30.63 
 
 		 474 aa  44.3  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4769  amidophosphoribosyltransferase  31.65 
 
 		 502 aa  43.5  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.573839  normal  0.111826 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1607  amidophosphoribosyltransferase  31.65 
 
 		 505 aa  43.5  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>