17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2853 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2853  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  400  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140453  normal  0.0482245 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3214  hypothetical protein  67.65 
 
 		 154 aa  185  4e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3021  hypothetical protein  71.93 
 
 		 153 aa  175  3e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2956  hypothetical protein  59.41 
 
 		 164 aa  119  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5031  hypothetical protein  48.82 
 
 		 170 aa  117  7.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.336697 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1281  hypothetical protein  39.64 
 
 		 188 aa  117  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.864029 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0636  hypothetical protein  40.14 
 
 		 175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.248742 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3632  hypothetical protein  50.5 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2051  hypothetical protein  40.82 
 
 		 182 aa  95.9  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.547362  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0412  hypothetical protein  40.95 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3134  hypothetical protein  39.22 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.408769  hitchhiker  0.0000561841 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2499  hypothetical protein  38.83 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0623161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0046  hypothetical protein  41.18 
 
 		 162 aa  53.9  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.185618 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2764  hypothetical protein  40.59 
 
 		 169 aa  52.8  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0044  hypothetical protein  36.89 
 
 		 156 aa  53.1  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000485186 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0841  hypothetical protein  35.21 
 
 		 208 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.162645  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3748  hypothetical protein  29.17 
 
 		 191 aa  44.7  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00286744  unclonable  0.000000761757 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>