21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2128 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2128  hypothetical protein  100 
 
 		 280 aa  571  1.0000000000000001e-162  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.491143  normal  0.87042 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3221  S1/P1 nuclease  33.21 
 
 		 272 aa  128  8.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0707943  normal  0.405467 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02316  endonuclease  40.91 
 
 		 257 aa  116  5e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1877  S1/P1 nuclease  31.21 
 
 		 307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0607718 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0491  S1/P1 nuclease  32.19 
 
 		 253 aa  112  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0943322  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2020  S1/P1 nuclease  31.21 
 
 		 287 aa  102  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304833  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07475  putative S1/P1 Nuclease  27.97 
 
 		 268 aa  102  7e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0413564  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0543  S1/P1 nuclease  28.01 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2113  S1/P1 nuclease  28.07 
 
 		 299 aa  98.6  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.420885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00211  putative S1/P1 Nuclease  32.97 
 
 		 268 aa  92.4  7e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0551  S1/P1 nuclease  33.21 
 
 		 285 aa  92  9e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.976409 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0244  S1/P1 nuclease  33.73 
 
 		 256 aa  88.2  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.863137  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0162  S1/P1 nuclease  25.98 
 
 		 268 aa  85.9  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.224354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0027  hypothetical protein  28.85 
 
 		 301 aa  85.1  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.512756 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9277  predicted protein  27.27 
 
 		 308 aa  81.6  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.509446  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02540  conserved hypothetical protein  34.55 
 
 		 393 aa  77  0.0000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5343  phospholipase C/P1 nuclease domain-containing protein  25.35 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.690717  normal  0.298135 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1528  hypothetical protein  24.75 
 
 		 277 aa  52.4  0.000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01677  putative signal peptide protein  24.71 
 
 		 337 aa  50.8  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.536357 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1908  hypothetical protein  34.62 
 
 		 321 aa  49.7  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.110697  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1455  hypothetical protein  24.41 
 
 		 279 aa  44.3  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>