26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1682 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1682  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  373  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.557508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5297  cupin 2 domain-containing protein  56 
 
 		 183 aa  201  6e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4799  cupin 2 domain-containing protein  50 
 
 		 177 aa  165  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.49808  normal  0.0689271 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3537  cupin 2, barrel  44.57 
 
 		 193 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.579632  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2395  cupin 2 domain-containing protein  40.66 
 
 		 192 aa  124  9e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.162048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1938  hypothetical protein  40.98 
 
 		 191 aa  123  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.73761  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3204  hypothetical protein  36.41 
 
 		 195 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3139  cupin 2 domain-containing protein  38.25 
 
 		 192 aa  118  4.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5492  transcriptional regulator protein  38.89 
 
 		 193 aa  113  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4825  cupin 2 domain-containing protein  38.76 
 
 		 198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4528  cupin 2 domain-containing protein  34.62 
 
 		 175 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.42906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1555  hypothetical protein  38.07 
 
 		 179 aa  100  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.401797 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1347  hypothetical protein  35.06 
 
 		 176 aa  91.3  8e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000835036  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3421  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 171 aa  84  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.357216  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1200  cupin 2 domain-containing protein  32.37 
 
 		 183 aa  78.6  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.375289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3026  cupin 2 domain-containing protein  32.98 
 
 		 176 aa  76.6  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3987  cupin 2 domain-containing protein  31.58 
 
 		 164 aa  73.6  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.966145  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5607  cupin 2 domain-containing protein  33.15 
 
 		 183 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.60204  normal  0.97721 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06743  hydrolase, CocE/NonD family, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00600)  29.06 
 
 		 793 aa  60.1  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0144437 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07635  Putative uncharacterized proteinPutative uncharacterized protein binA ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O74707]  33.64 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.837301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1171  hypothetical protein  25.66 
 
 		 162 aa  51.6  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.355646 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04830  hypothetical protein  25.68 
 
 		 195 aa  51.6  0.000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3009  hypothetical protein  33.93 
 
 		 241 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4820  hypothetical protein  26.32 
 
 		 141 aa  43.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0707469  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05730  hypothetical protein  40 
 
 		 179 aa  42  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.26234  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1913  hypothetical protein  39.53 
 
 		 141 aa  42  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.421142  normal  0.261472 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>