17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_27310 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_27310  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  554  1e-157  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5754  hypothetical protein  58.21 
 
 		 243 aa  84  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3253  hypothetical protein  49.4 
 
 		 276 aa  75.9  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.313329  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3431  hypothetical protein  50 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306907  decreased coverage  0.00685853 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3205  hypothetical protein  49.3 
 
 		 194 aa  61.6  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.623642 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4003  hypothetical protein  41.54 
 
 		 203 aa  53.1  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3309  putative transmembrane protein  37.8 
 
 		 135 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00621908 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3258  putative transmembrane protein  37.8 
 
 		 135 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229756  normal  0.598915 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3247  putative transmembrane protein  37.8 
 
 		 135 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0753  nuclease  43.24 
 
 		 237 aa  47.8  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.838035  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2918  hypothetical protein  50 
 
 		 378 aa  46.6  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000443349  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3514  hypothetical protein  39.44 
 
 		 118 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102263 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2997  hypothetical protein  36.14 
 
 		 131 aa  45.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.400946  normal  0.30585 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2752  beta-lactamase-like protein  34.04 
 
 		 443 aa  45.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0706  copper amine oxidase domain-containing protein  33.9 
 
 		 298 aa  43.9  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2879  hypothetical protein  45.83 
 
 		 632 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12174  hypothetical protein  41.77 
 
 		 118 aa  42.7  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.632259 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>