34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_22040 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_22040  Protein of unknown function (DUF797)  100 
 
 
63 aa  122  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00887509  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2158  protein of unknown function DUF797  68.75 
 
 
64 aa  82.8  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2462  protein of unknown function DUF797  68.25 
 
 
63 aa  75.5  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0161544  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3076  hypothetical protein  67.19 
 
 
64 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.172307 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3450  hypothetical protein  65.62 
 
 
64 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.552119  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2240  protein of unknown function DUF797  94.87 
 
 
64 aa  73.9  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0242116  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12143  hypothetical protein  67.19 
 
 
64 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0287467  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3192  hypothetical protein  81.4 
 
 
64 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516588  normal  0.0703128 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3142  hypothetical protein  81.4 
 
 
64 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.431987 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1187  hypothetical protein  61.29 
 
 
71 aa  67  0.00000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.208283  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2425  protein of unknown function DUF797  54.1 
 
 
69 aa  67  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00189878  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1835  hypothetical protein  72.73 
 
 
69 aa  65.5  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5879  hypothetical protein  60.34 
 
 
69 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107356  normal  0.769255 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4880  hypothetical protein  67.39 
 
 
72 aa  63.9  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.186238 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2644  hypothetical protein  55.38 
 
 
65 aa  63.5  0.0000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.772222  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2970  protein of unknown function DUF797  68.75 
 
 
64 aa  63.5  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00165845  normal  0.0226218 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2628  hypothetical protein  65.22 
 
 
72 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.942181  normal  0.261485 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1494  protein of unknown function DUF797  55.93 
 
 
67 aa  62  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.026873 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2309  protein of unknown function DUF797  76.32 
 
 
69 aa  62.4  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000265937  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2360  hypothetical protein  68.18 
 
 
71 aa  60.5  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0376484 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2243  hypothetical protein  68.09 
 
 
96 aa  60.5  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.426448  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2680  protein of unknown function DUF797  71.05 
 
 
69 aa  60.1  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.136561  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1791  hypothetical protein  78.38 
 
 
67 aa  59.7  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.441834  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4462  hypothetical protein  61.9 
 
 
71 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.169553 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2002  protein of unknown function DUF797  50.85 
 
 
64 aa  54.3  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.425274  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11910  Protein of unknown function (DUF797)  44.44 
 
 
63 aa  53.9  0.0000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.236473  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2175  hypothetical protein  56 
 
 
74 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00489951  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0909  protein of unknown function DUF797  44.26 
 
 
64 aa  51.6  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.115222  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20880  Protein of unknown function (DUF797)  73.33 
 
 
63 aa  48.9  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1872  protein of unknown function DUF797  70 
 
 
65 aa  48.9  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16180  Protein of unknown function (DUF797)  46.15 
 
 
62 aa  49.3  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0211334  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1487  protein of unknown function DUF797  73.33 
 
 
68 aa  48.5  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1918  protein of unknown function DUF797  74.19 
 
 
67 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000647128 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2239  protein of unknown function DUF797  70.97 
 
 
62 aa  47  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.192803  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>