24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_20490 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_20490  uncharacterized RAMP superfamily protein probably involved in DNA repair  100 
 
 		 670 aa  1366    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1246  hypothetical protein  29.17 
 
 		 719 aa  207  6e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.534306  normal  0.385301 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1065  hypothetical protein  26.35 
 
 		 698 aa  108  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3289  hypothetical protein  25.17 
 
 		 699 aa  97.1  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3290  hypothetical protein  27.86 
 
 		 699 aa  92.8  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1856  hypothetical protein  26.21 
 
 		 712 aa  89.7  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.121377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1068  hypothetical protein  27.06 
 
 		 698 aa  86.7  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1857  hypothetical protein  29.55 
 
 		 711 aa  73.2  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1006  hypothetical protein  24.94 
 
 		 950 aa  59.3  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.601621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1374  hypothetical protein  27.84 
 
 		 756 aa  55.8  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1920  hypothetical protein  25.95 
 
 		 719 aa  54.3  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1832  hypothetical protein  32.08 
 
 		 666 aa  52  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2049  hypothetical protein  28.85 
 
 		 294 aa  50.4  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0362  hypothetical protein  36.29 
 
 		 321 aa  50.4  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2524  hypothetical protein  24.41 
 
 		 744 aa  49.7  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0987  protein of unknown function DUF324  23.88 
 
 		 331 aa  49.3  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0140  protein of unknown function DUF324  26.63 
 
 		 615 aa  48.5  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2394  hypothetical protein  35.14 
 
 		 357 aa  47.4  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.621441  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0185  hypothetical protein  34.95 
 
 		 319 aa  45.8  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1798  putative CRISPR-associated RAMP family protein  25 
 
 		 339 aa  45.4  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1445  hypothetical protein  23.1 
 
 		 330 aa  44.7  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0696402 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0183  cold-shock DNA-binding protein family protein  30.14 
 
 		 882 aa  44.3  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3214  hypothetical protein  27.37 
 
 		 661 aa  44.3  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0158  hypothetical protein  26.13 
 
 		 390 aa  43.9  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.59719 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>