25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_19300 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_19300  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  298  1e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.261784  normal  0.275574 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1520  hypothetical protein  52.7 
 
 		 176 aa  149  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00240031  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4571  hypothetical protein  52.78 
 
 		 174 aa  137  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.6228  normal  0.0680023 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3245  hypothetical protein  54.24 
 
 		 164 aa  114  5e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00724538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0024  hypothetical protein  34.4 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.441006  normal  0.869283 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3003  hypothetical protein  39.01 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.793652  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0948  hypothetical protein  31.51 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.491817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1450  hypothetical protein  37.18 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1067  hypothetical protein  38.39 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0843  hypothetical protein  39.74 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.158916 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1792  hypothetical protein  35.14 
 
 		 164 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2889  hypothetical protein  37.38 
 
 		 146 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0730  hypothetical protein  28.28 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.383544  normal  0.466048 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0750  hypothetical protein  28.28 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.162502 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0736  hypothetical protein  28.28 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.124352  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3168  hypothetical protein  33.96 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0460452  normal  0.10109 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2903  hypothetical protein  36.45 
 
 		 146 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.234456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2859  hypothetical protein  36.45 
 
 		 146 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2083  hypothetical protein  36.36 
 
 		 166 aa  42  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0702  hypothetical protein  37.36 
 
 		 129 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.149977  normal  0.107054 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0689  hypothetical protein  37.36 
 
 		 129 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.305298  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2595  hypothetical protein  33.11 
 
 		 151 aa  41.6  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.484392  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3126  hypothetical protein  36.36 
 
 		 159 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.336493  normal  0.576485 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0682  hypothetical protein  51.06 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0239425  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1500  hypothetical protein  37.27 
 
 		 158 aa  40.8  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.978644  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>