26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_16310 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_16310  transcriptional regulator  100 
 
 		 69 aa  134  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.472686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5133  transcriptional regulator  94.2 
 
 		 69 aa  127  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.459698  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2290  hypothetical protein  78.79 
 
 		 82 aa  103  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000784834  hitchhiker  0.00592267 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2207  putative transcriptional regulator  73.91 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.404102  normal  0.37426 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1674  transcriptional regulator  73.91 
 
 		 72 aa  101  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0860808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2272  transcriptional regulator  74.29 
 
 		 72 aa  100  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1960  transcriptional regulator  74.29 
 
 		 75 aa  100  9e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.387495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5971  transcriptional regulator  75.76 
 
 		 71 aa  99.4  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.104389 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2239  hypothetical protein  73.91 
 
 		 70 aa  99  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000652309  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1141  transcriptional regulator  72.41 
 
 		 72 aa  88.6  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0337551 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1879  transcriptional regulator  68.85 
 
 		 70 aa  87  7e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00500027  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2073  putative transcriptional regulator  64.71 
 
 		 75 aa  87  8e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3300  hypothetical protein  68.75 
 
 		 75 aa  84.7  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100212 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3073  hypothetical protein  68.75 
 
 		 75 aa  84.7  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.818118  normal  0.0734674 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2909  hypothetical protein  63.64 
 
 		 86 aa  83.2  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2801  hypothetical protein  66.67 
 
 		 68 aa  81.3  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0678708  normal  0.0744334 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11502  transcriptional regulator  57.69 
 
 		 63 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.286718 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3667  hypothetical protein  49.06 
 
 		 64 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.223914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3859  hypothetical protein  59.26 
 
 		 75 aa  60.1  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.742903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2447  hypothetical protein  54.9 
 
 		 66 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2484  hypothetical protein  54.9 
 
 		 66 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2492  hypothetical protein  54.9 
 
 		 66 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.14042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2743  hypothetical protein  48.08 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.309945  normal  0.479976 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3646  helix-turn-helix domain protein  48 
 
 		 301 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.858405  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0074  hypothetical protein  40 
 
 		 118 aa  40.8  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2177  resolvase domain-containing protein  37.04 
 
 		 139 aa  40.4  0.009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000287507 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>