23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2743 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_2743  hypothetical protein  100 
 
 
87 aa  172  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.309945  normal  0.479976 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3667  hypothetical protein  79.69 
 
 
64 aa  107  7.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.223914  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2484  hypothetical protein  75 
 
 
66 aa  97.1  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2447  hypothetical protein  73.44 
 
 
66 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2492  hypothetical protein  73.44 
 
 
66 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.14042  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11502  transcriptional regulator  72.13 
 
 
63 aa  89  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.286718 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5133  transcriptional regulator  48.15 
 
 
69 aa  59.7  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.459698  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2272  transcriptional regulator  50 
 
 
72 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16310  transcriptional regulator  48.08 
 
 
69 aa  57.8  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.472686  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2239  hypothetical protein  48.33 
 
 
70 aa  57.4  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000652309  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2207  putative transcriptional regulator  50 
 
 
72 aa  57  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.404102  normal  0.37426 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1674  transcriptional regulator  50 
 
 
72 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0860808  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2290  hypothetical protein  46.15 
 
 
82 aa  56.2  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000784834  hitchhiker  0.00592267 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5971  transcriptional regulator  48.15 
 
 
71 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.104389 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2801  hypothetical protein  45.45 
 
 
68 aa  55.1  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0678708  normal  0.0744334 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2073  putative transcriptional regulator  45.76 
 
 
75 aa  54.7  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1879  transcriptional regulator  43.86 
 
 
70 aa  54.3  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00500027  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1960  transcriptional regulator  46.3 
 
 
75 aa  53.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.387495 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2909  hypothetical protein  36.36 
 
 
86 aa  51.6  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3300  hypothetical protein  47.27 
 
 
75 aa  50.8  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100212 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3073  hypothetical protein  47.27 
 
 
75 aa  50.8  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.818118  normal  0.0734674 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3859  hypothetical protein  41.94 
 
 
75 aa  50.4  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.742903  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1141  transcriptional regulator  45.61 
 
 
72 aa  49.7  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0337551 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>