25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_14450 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_14450  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  273  5e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.408221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5498  hypothetical protein  73.55 
 
 		 130 aa  179  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00390859  normal  0.0589303 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1756  hypothetical protein  66.41 
 
 		 134 aa  176  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.721453  normal  0.723932 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4587  ChaB family protein  65.22 
 
 		 138 aa  174  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0893  hypothetical protein  67.65 
 
 		 134 aa  174  3e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2742  ChaB family protein  68.7 
 
 		 131 aa  174  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.764397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1742  hypothetical protein  64.12 
 
 		 137 aa  167  5e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.198279  hitchhiker  0.00269492 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3652  ChaB  60.94 
 
 		 139 aa  159  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3725  ChaB family protein  60.94 
 
 		 139 aa  159  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.794825 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3411  hypothetical protein  61.83 
 
 		 141 aa  156  7e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3007  ChaB family protein  65.62 
 
 		 141 aa  156  9e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000471912  hitchhiker  0.000140663 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3665  ChaB family protein  60.16 
 
 		 139 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.764782  normal  0.692759 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1804  hypothetical protein  63.33 
 
 		 133 aa  154  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2019  ChaB family protein  60.87 
 
 		 142 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000742631  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0871  ChaB family protein  59.38 
 
 		 140 aa  150  7e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0793  ChaB family protein  57.03 
 
 		 139 aa  150  7e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02480  ChaB protein  58.73 
 
 		 141 aa  147  6e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1538  hypothetical protein  61.36 
 
 		 153 aa  140  5e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.213562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4490  ChaB family protein  58.59 
 
 		 134 aa  137  4.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0526847 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0646  hypothetical protein  63.16 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.212732  normal  0.49792 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3850  hypothetical protein  61.29 
 
 		 86 aa  45.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0876589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23330  hypothetical protein  58.06 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01038  hypothetical protein  56.67 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0473132  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5375  hypothetical protein  60 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2246  Ku protein  37.93 
 
 		 340 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.362635 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>