17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_11170 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_11170  hypothetical protein  100 
 
 		 301 aa  605  9.999999999999999e-173  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0898011 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0562  hypothetical protein  57.04 
 
 		 294 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3276  hypothetical protein  54.11 
 
 		 298 aa  283  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.928112  normal  0.235681 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0282  hypothetical protein  50.52 
 
 		 294 aa  259  4e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6168  hypothetical protein  49.83 
 
 		 291 aa  253  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6450  hypothetical protein  39.04 
 
 		 290 aa  181  9.000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0170653 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4541  hypothetical protein  36.75 
 
 		 304 aa  157  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5087  hypothetical protein  35.25 
 
 		 296 aa  153  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.692279 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1075  hypothetical protein  36.61 
 
 		 286 aa  146  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3163  hypothetical protein  35.47 
 
 		 302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.0045094  normal  0.153591 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1177  hypothetical protein  36.6 
 
 		 305 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.11643  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5307  hypothetical protein  32.56 
 
 		 299 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.522562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13860  hypothetical protein  30.38 
 
 		 286 aa  115  8.999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1564  hypothetical protein  32.9 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.234397  normal  0.812381 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2209  hypothetical protein  26.28 
 
 		 314 aa  55.8  0.0000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000355617  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0531  hypothetical protein  34.67 
 
 		 306 aa  55.1  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2014  hypothetical protein  30.3 
 
 		 314 aa  53.1  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>