22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_06340 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_06340  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  208  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0779  hypothetical protein  70.21 
 
 		 191 aa  122  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1171  DivIVA domain protein  54.65 
 
 		 106 aa  99.4  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2146  hypothetical protein  47.25 
 
 		 126 aa  100  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00360758  hitchhiker  0.00871202 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11233  hypothetical protein  50.6 
 
 		 122 aa  87.4  6e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.155825  normal  0.0761739 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4507  hypothetical protein  53.95 
 
 		 122 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2188  hypothetical protein  53.95 
 
 		 121 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.543165  normal  0.744038 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3309  DivIVA domain protein  47.47 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4004  hypothetical protein  56.92 
 
 		 103 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0130375  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4078  hypothetical protein  56.92 
 
 		 103 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.116498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4234  hypothetical protein  56.92 
 
 		 103 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.326138 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1095  DivIVA domain protein  41.54 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.423164  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3838  hypothetical protein  46.43 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0245433 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19450  hypothetical protein  31.25 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.735309  normal  0.0185539 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0497  hypothetical protein  32.35 
 
 		 174 aa  45.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3020  hypothetical protein  35 
 
 		 136 aa  43.9  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7945  hypothetical protein  33.33 
 
 		 185 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0650  hypothetical protein  35.44 
 
 		 167 aa  42.7  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.192275  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0878  hypothetical protein  41.07 
 
 		 206 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1202  hypothetical protein  31.33 
 
 		 100 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2519  hypothetical protein  37.1 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000151548 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2799  hypothetical protein  32.76 
 
 		 119 aa  40.4  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.374089  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>