11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_02800 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_02800  hypothetical protein  100 
 
 		 375 aa  726    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6737  hypothetical protein  32.99 
 
 		 409 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0419  hypothetical protein  30.22 
 
 		 294 aa  54.3  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00830783 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0488  hypothetical protein  30.69 
 
 		 384 aa  53.5  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.659139  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2777  hypothetical protein  27.48 
 
 		 428 aa  53.5  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1303  hypothetical protein  40.79 
 
 		 548 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.480323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1659  hypothetical protein  28.14 
 
 		 504 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230757 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0543  hypothetical protein  27.15 
 
 		 223 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.357985 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  36.56 
 
 		 2449 aa  43.9  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5691  hypothetical protein  27.23 
 
 		 330 aa  43.5  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0596359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0349  hypothetical protein  28.65 
 
 		 294 aa  43.5  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>