20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_01020 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_01020  hypothetical protein  100 
 
 		 265 aa  524  1e-148  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.551056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0086  hypothetical protein  55.51 
 
 		 252 aa  258  5.0000000000000005e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5663  hypothetical protein  40.29 
 
 		 266 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.570228  normal  0.031893 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1144  hypothetical protein  40.94 
 
 		 262 aa  171  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0437754  normal  0.0600359 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5416  hypothetical protein  40.38 
 
 		 273 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.720653 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5123  hypothetical protein  40.86 
 
 		 273 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5035  hypothetical protein  40.86 
 
 		 273 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478357  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5476  hypothetical protein  38.82 
 
 		 254 aa  148  8e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0174  hypothetical protein  47.03 
 
 		 263 aa  146  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0142  hypothetical protein  38.25 
 
 		 245 aa  135  5e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13873  hypothetical protein  34.46 
 
 		 258 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2657  hypothetical protein  34.85 
 
 		 244 aa  110  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00775221  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0175  hypothetical protein  31.12 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0933557  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4368  hypothetical protein  32 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4935  hypothetical protein  27.52 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4817  hypothetical protein  33 
 
 		 239 aa  63.5  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1109  hypothetical protein  31.46 
 
 		 327 aa  59.3  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182239  normal  0.383462 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3405  hypothetical protein  27.66 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214353  normal  0.0597402 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4816  hypothetical protein  32.37 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.536398 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4367  hypothetical protein  33.33 
 
 		 304 aa  54.7  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>