18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1271 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1271  colicin V production protein  100 
 
 
216 aa  410  1e-113  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1144  CvpA family protein  46.5 
 
 
191 aa  136  2e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.111431  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1558  cvpA family protein  43.64 
 
 
190 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.383217  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0486  conserved hypothetical integral membrane protein, CvpA family  41.77 
 
 
189 aa  125  4.0000000000000003e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0578  Colicin V production protein  42.42 
 
 
184 aa  124  8.000000000000001e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.637194  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0422  cvpA family protein  42.35 
 
 
187 aa  123  2e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00865734  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0448  cvpA family protein  41.82 
 
 
187 aa  123  2e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.179388  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0223  CvpA family protein  37.28 
 
 
206 aa  116  3e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.903437  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0999  CvpA family protein  37.85 
 
 
205 aa  101  1e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000386189  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1644  CvpA family protein  31.15 
 
 
218 aa  94.7  8e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2162  colicin V production protein  26.49 
 
 
193 aa  61.6  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.340208  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3077  Colicin V production protein  29.46 
 
 
158 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.770622 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2875  putative bacteriocin production related protein  31.52 
 
 
164 aa  43.5  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2461  colicin V production protein  26.83 
 
 
165 aa  42.7  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.400499  normal  0.228634 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1872  colicin V production protein  26.9 
 
 
159 aa  42.4  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.356571  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0771  colicin V production protein  26.18 
 
 
182 aa  42  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0510  Colicin V production protein  24.86 
 
 
190 aa  41.6  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.103168  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0552  Colicin V production protein  27.68 
 
 
162 aa  41.6  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>