11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3954 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3954  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  210  5.999999999999999e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3961  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  210  5.999999999999999e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4345  hypothetical protein  70.19 
 
 		 104 aa  148  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.1779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0343  hypothetical protein  52.38 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.84343  hitchhiker  0.00208243 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0298  hypothetical protein  50.82 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2967  hypothetical protein  47.76 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000179901 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1519  hypothetical protein  46.27 
 
 		 107 aa  57  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0202167 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1546  hypothetical protein  44.12 
 
 		 83 aa  55.1  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0733135  hitchhiker  0.00782478 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0258  hypothetical protein  39.71 
 
 		 119 aa  44.3  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.990108  normal  0.0309417 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0300  hypothetical protein  42.62 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0391304 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6222  hypothetical protein  37.5 
 
 		 197 aa  40.4  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>