41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3948 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4339  hypothetical protein  88.29 
 
 		 820 aa  1311    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3948  hypothetical protein  100 
 
 		 820 aa  1558    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0508  hypothetical protein  47.22 
 
 		 759 aa  573  1.0000000000000001e-162  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0804  hypothetical protein  43.1 
 
 		 752 aa  457  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.613631  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34230  hypothetical protein  41.75 
 
 		 751 aa  458  1e-127  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.604302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8905  hypothetical protein  39.31 
 
 		 789 aa  409  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.826763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0463  hypothetical protein  42.48 
 
 		 747 aa  408  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4401  hypothetical protein  38.42 
 
 		 837 aa  397  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.433686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0814  hypothetical protein  40.05 
 
 		 790 aa  397  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3610  hypothetical protein  37.83 
 
 		 789 aa  367  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.746479  normal  0.160481 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3295  hypothetical protein  41.63 
 
 		 857 aa  361  3e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.255301 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1222  hypothetical protein  36.85 
 
 		 777 aa  358  1.9999999999999998e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4772  hypothetical protein  35.71 
 
 		 758 aa  352  1e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4867  hypothetical protein  38 
 
 		 764 aa  350  4e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0900282 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10879  hypothetical protein  37.32 
 
 		 756 aa  349  1e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.112586 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4571  hypothetical protein  38 
 
 		 764 aa  348  2e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0747645 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4484  hypothetical protein  38.08 
 
 		 739 aa  347  3e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5054  hypothetical protein  37.47 
 
 		 751 aa  340  9e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8093  hypothetical protein  38.08 
 
 		 761 aa  336  9e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0172  hypothetical protein  41.53 
 
 		 876 aa  335  2e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.211375 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1699  hypothetical protein  36.03 
 
 		 748 aa  332  2e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.713672 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3945  hypothetical protein  38.89 
 
 		 758 aa  324  5e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.404517  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0788  hypothetical protein  32.74 
 
 		 834 aa  265  3e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0815  hypothetical protein  34.58 
 
 		 726 aa  257  6e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0906  hypothetical protein  30.74 
 
 		 826 aa  254  7e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.504843 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0847  hypothetical protein  35.26 
 
 		 762 aa  232  2e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.435932  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31420  hypothetical protein  38.93 
 
 		 953 aa  221  3.9999999999999997e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.937123  normal  0.115197 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2510  hypothetical protein  32.27 
 
 		 798 aa  208  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.90638 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2048  hypothetical protein  29.19 
 
 		 822 aa  205  2e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2931  hypothetical protein  42.98 
 
 		 745 aa  204  7e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21530  hypothetical protein  33.37 
 
 		 779 aa  199  2.0000000000000003e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.636597  hitchhiker  0.000150797 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3427  hypothetical protein  30.34 
 
 		 840 aa  165  3e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1999  hypothetical protein  28.38 
 
 		 856 aa  147  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0638496 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07970  hypothetical protein  31.59 
 
 		 719 aa  130  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.281688  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0726  hypothetical protein  48.06 
 
 		 817 aa  124  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0231396  hitchhiker  0.000141757 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34360  DNA/RNA helicase, superfamily II  31.45 
 
 		 548 aa  52  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0810  helicase domain protein  32.56 
 
 		 550 aa  49.3  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4794  helicase domain protein  31.58 
 
 		 554 aa  49.3  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.767422 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0173  helicase domain-containing protein  32.24 
 
 		 545 aa  47.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0878922 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0453  type III restriction protein res subunit  33.33 
 
 		 550 aa  46.2  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0803  type III restriction protein res subunit  30.92 
 
 		 561 aa  45.1  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.310817  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>