12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3881 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3881  hypothetical protein  100 
 
 		 100 aa  203  8e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4272  hypothetical protein  91 
 
 		 100 aa  189  8e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0273731  hitchhiker  0.00830783 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3895  hypothetical protein  51.02 
 
 		 113 aa  95.5  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.18342 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1440  hypothetical protein  37.5 
 
 		 95 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3161  hypothetical protein  33.68 
 
 		 140 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2955  hypothetical protein  32.98 
 
 		 129 aa  50.8  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0106783 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4900  hypothetical protein  35.11 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3912  hypothetical protein  35.79 
 
 		 147 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.243532  normal  0.0732889 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5852  hypothetical protein  32.63 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.515868  hitchhiker  0.00131166 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1420  cupin 2, barrel  32.95 
 
 		 95 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.809174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3964  cupin 2, barrel  31.11 
 
 		 95 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0415147  normal  0.762115 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4658  hypothetical protein  32.95 
 
 		 95 aa  40.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.768607  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>