16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1519 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_1519  hypothetical protein  100 
 
 
107 aa  208  3e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0202167 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2967  hypothetical protein  86.17 
 
 
107 aa  155  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000179901 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0343  hypothetical protein  61.97 
 
 
134 aa  70.5  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.84343  hitchhiker  0.00208243 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0298  hypothetical protein  54.93 
 
 
131 aa  61.2  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1546  hypothetical protein  48.68 
 
 
83 aa  61.2  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0733135  hitchhiker  0.00782478 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4345  hypothetical protein  48.57 
 
 
104 aa  58.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.1779  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3954  hypothetical protein  46.27 
 
 
104 aa  57  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3961  hypothetical protein  46.27 
 
 
104 aa  57  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6222  hypothetical protein  48.39 
 
 
197 aa  54.7  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0258  hypothetical protein  40.74 
 
 
119 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.990108  normal  0.0309417 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3254  DivIVA domain protein  46.15 
 
 
240 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.309743  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4004  DivIVA family protein  31.18 
 
 
254 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693665  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0300  hypothetical protein  37.29 
 
 
120 aa  41.2  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0391304 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3432  DivIVA family protein  46.15 
 
 
271 aa  40.4  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.608556  hitchhiker  0.00685853 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1319  DivIVA family protein  24.32 
 
 
199 aa  40.4  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.290903  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5755  DivIVA family protein  46.15 
 
 
273 aa  40  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>