29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1387 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1387  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  393  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1345  hypothetical protein  75.68 
 
 		 222 aa  310  6.999999999999999e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.405691  decreased coverage  0.0000428453 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2234  hypothetical protein  46.76 
 
 		 221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687189 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0847  hypothetical protein  40.34 
 
 		 170 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14880  hypothetical protein  40.91 
 
 		 155 aa  70.9  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0219247  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4717  hypothetical protein  40 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.729727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3698  hypothetical protein  39.16 
 
 		 141 aa  62  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.309374  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3177  hypothetical protein  35.04 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.421028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1885  hypothetical protein  42.16 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0572068  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11632  hypothetical protein  34.35 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.079961 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4905  hypothetical protein  36.89 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.159227  hitchhiker  0.00546227 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3594  hypothetical protein  35.71 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.32654  normal  0.529723 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2011  hypothetical protein  36 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.837589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6425  hypothetical protein  30.99 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2938  hypothetical protein  38.83 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.904567 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3029  hypothetical protein  34.15 
 
 		 127 aa  52.4  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0371  hypothetical protein  38 
 
 		 145 aa  51.6  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37992e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0848  hypothetical protein  28.06 
 
 		 136 aa  51.6  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.276759 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3104  hypothetical protein  34.09 
 
 		 137 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2222  hypothetical protein  31.82 
 
 		 150 aa  50.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3045  hypothetical protein  34.09 
 
 		 137 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3061  hypothetical protein  33.83 
 
 		 137 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130056  normal  0.220176 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2821  hypothetical protein  37.76 
 
 		 137 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.650851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5672  hypothetical protein  37.86 
 
 		 124 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0129  hypothetical protein  34.02 
 
 		 139 aa  44.7  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0704993  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2876  putative transmembrane protein  43.01 
 
 		 142 aa  44.3  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000745882  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5433  hypothetical protein  34.29 
 
 		 141 aa  43.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00625909  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1163  hypothetical protein  39.25 
 
 		 154 aa  43.1  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567834  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2592  hypothetical protein  41.86 
 
 		 155 aa  42.4  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000455117  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>