16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0481 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0481  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  296  4e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.571872  normal  0.104037 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9099  hypothetical protein  37.9 
 
 
134 aa  101  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9190  hypothetical protein  39 
 
 
133 aa  75.5  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8102  hypothetical protein  43.01 
 
 
134 aa  74.7  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4831  hypothetical protein  34.04 
 
 
138 aa  59.7  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000648077 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8527  hypothetical protein  26.32 
 
 
151 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0143221 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21050  hypothetical protein  36.71 
 
 
171 aa  47.8  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0401798  normal  0.348603 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0934  hypothetical protein  26.67 
 
 
163 aa  47.4  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5552  hypothetical protein  29.35 
 
 
120 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630882  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6386  hypothetical protein  30.21 
 
 
163 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.320315  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03920  hypothetical protein  28.72 
 
 
195 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05930  hypothetical protein  32.98 
 
 
187 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8082  hypothetical protein  31.51 
 
 
137 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.780581  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6455  hypothetical protein  35.62 
 
 
174 aa  41.2  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0649  conserved hypothetical protein DUF149  29.11 
 
 
114 aa  40.4  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0145182  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2641  hypothetical protein  32.79 
 
 
184 aa  40.4  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.959091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>