25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2643 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0284  transposase IS4 family protein  98.78 
 
 
1095 bp  1392    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2655    99.06 
 
 
2330 bp  815    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.000297792  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2643    100 
 
 
1285 bp  2547    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2632  transposase IS4 family protein  98.92 
 
 
1095 bp  1400    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.17948  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2347  transposase IS4 family protein  98.78 
 
 
1095 bp  1392    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0455002  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2325    98.89 
 
 
2327 bp  1021    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0486807  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2273  transposase IS4 family protein  98.78 
 
 
1095 bp  1392    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2194    98.22 
 
 
756 bp  724    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1447    98.72 
 
 
564 bp  1025    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0342292  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1351  transposase IS4 family protein  98.92 
 
 
1095 bp  1400    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0683    99.26 
 
 
2327 bp  1037    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.000431715  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0283    98.78 
 
 
2747 bp  1392    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0533    87.31 
 
 
2426 bp  392  1e-107  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0698    98.37 
 
 
1078 bp  341  2.9999999999999997e-91  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2340    97.83 
 
 
669 bp  333  7e-89  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.263028  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2517    95.65 
 
 
920 bp  301  3e-79  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.245299  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2481    95.45 
 
 
102 bp  107  8e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.100527  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2144    85.59 
 
 
1009 bp  93.7  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2378    85.59 
 
 
978 bp  93.7  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2516    88.24 
 
 
219 bp  89.7  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.187004  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0738    82.05 
 
 
974 bp  87.7  0.000000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.000736258  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1580    94.12 
 
 
1141 bp  77.8  0.000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2745  hypothetical protein  92.86 
 
 
447 bp  60  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.493  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0600    91.11 
 
 
1025 bp  58  0.000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000130033  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2417    96.67 
 
 
779 bp  52  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.008461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>