19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2194 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0284  transposase IS4 family protein  99.33 
 
 
1095 bp  1447    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2655    99.7 
 
 
2330 bp  1324    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.000297792  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2643    98.22 
 
 
1285 bp  724    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2632  transposase IS4 family protein  99.87 
 
 
1095 bp  1479    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.17948  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2347  transposase IS4 family protein  99.6 
 
 
1095 bp  1463    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0455002  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2325    99.6 
 
 
2327 bp  1463    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0486807  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2273  transposase IS4 family protein  99.6 
 
 
1095 bp  1463    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2194    100 
 
 
756 bp  1499    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1351  transposase IS4 family protein  99.87 
 
 
1095 bp  1479    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0683    99.6 
 
 
2327 bp  1463    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.000431715  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0283    99.33 
 
 
2747 bp  1447    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0533    88.86 
 
 
2426 bp  496  9.999999999999999e-139  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1447    99 
 
 
564 bp  381  1e-103  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0342292  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2516    89.41 
 
 
219 bp  97.6  4e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.187004  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2144    85.59 
 
 
1009 bp  93.7  7e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2378    85.59 
 
 
978 bp  93.7  7e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0738    82.05 
 
 
974 bp  87.7  0.000000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.000736258  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2745  hypothetical protein  92.86 
 
 
447 bp  60  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.493  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0600    91.11 
 
 
1025 bp  58  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000130033  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>