20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2144 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_2144    100 
 
 
1009 bp  2000    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2378    97.85 
 
 
978 bp  1766    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0600    86.73 
 
 
1025 bp  170  5e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000130033  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2820    86.01 
 
 
1022 bp  168  2.0000000000000002e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2417    86.08 
 
 
779 bp  163  1e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.008461  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2325    85.59 
 
 
2327 bp  93.7  9e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0486807  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2655    85.59 
 
 
2330 bp  93.7  9e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.000297792  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2643    85.59 
 
 
1285 bp  93.7  9e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2632  transposase IS4 family protein  85.59 
 
 
1095 bp  93.7  9e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.17948  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2347  transposase IS4 family protein  85.59 
 
 
1095 bp  93.7  9e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0455002  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0283    85.59 
 
 
2747 bp  93.7  9e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2273  transposase IS4 family protein  85.59 
 
 
1095 bp  93.7  9e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2194    85.59 
 
 
756 bp  93.7  9e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1351  transposase IS4 family protein  85.59 
 
 
1095 bp  93.7  9e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0683    85.59 
 
 
2327 bp  93.7  9e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.000431715  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0284  transposase IS4 family protein  85.59 
 
 
1095 bp  93.7  9e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0738    83.08 
 
 
974 bp  67.9  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.000736258  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0533    94.59 
 
 
2426 bp  58  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2516    96.88 
 
 
219 bp  56  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.187004  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2745  hypothetical protein  90.24 
 
 
447 bp  50.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.493  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>