12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1193 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1193  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 
299 aa  598  1e-170  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0125  hypothetical protein  47.19 
 
 
296 aa  283  3.0000000000000004e-75  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00861839  hitchhiker  0.000869634 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2732  hypothetical protein  23.88 
 
 
317 aa  65.9  0.0000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.701847  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0437  hypothetical protein  23.59 
 
 
308 aa  57.8  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.347736  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0361  DNA polymerase beta subunit  25.08 
 
 
352 aa  57  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.10679  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1443  DNA polymerase beta subunit  25.39 
 
 
351 aa  53.5  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1976  hypothetical protein  24.35 
 
 
310 aa  52.4  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.33772  normal  0.678453 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0052  hypothetical protein  23.26 
 
 
309 aa  52  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0476  DNA polymerase beta subunit  26.54 
 
 
351 aa  51.2  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.115268  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1924  hypothetical protein  23.49 
 
 
313 aa  47.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.618938  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0563  hypothetical protein  23.38 
 
 
309 aa  45.8  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.411197  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0461  DNA polymerase beta subunit  21.33 
 
 
311 aa  45.1  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>