20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1179 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1179  Protein of unknown function DUF460  100 
 
 
613 aa  1201    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.237227  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0232  hypothetical protein  47.37 
 
 
602 aa  572  1e-161  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0116565 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0738  hypothetical protein  34.61 
 
 
662 aa  257  4e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  unclonable  0.00000149054  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0547  hypothetical protein  31.33 
 
 
654 aa  224  3e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0419873  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2334  hypothetical protein  28.62 
 
 
585 aa  205  2e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0927872  hitchhiker  0.00309238 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0690  hypothetical protein  28.59 
 
 
591 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.120921 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0863  hypothetical protein  29.32 
 
 
639 aa  194  4e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.949823  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0481  hypothetical protein  35.83 
 
 
650 aa  193  6e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.93354  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3698  hypothetical protein  30.2 
 
 
662 aa  190  8e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.376692 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1976  hypothetical protein  28.48 
 
 
584 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0054  Protein of unknown function DUF460  30.3 
 
 
658 aa  177  6e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2604  hypothetical protein  31.45 
 
 
646 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2104  hypothetical protein  27.34 
 
 
583 aa  172  2e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1193  Protein of unknown function DUF460  31.68 
 
 
669 aa  170  6e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2320  hypothetical protein  31.82 
 
 
663 aa  167  4e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.434022 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1871  Protein of unknown function DUF460  28.71 
 
 
657 aa  165  2.0000000000000002e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0706  Protein of unknown function DUF460  26.69 
 
 
658 aa  154  4e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.474274  normal  0.739297 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2183  Protein of unknown function DUF460  29.49 
 
 
658 aa  139  2e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2504  Protein of unknown function DUF460  31.98 
 
 
697 aa  126  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.459934 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0435  hypothetical protein  28.15 
 
 
767 aa  124  4e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>