19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0702 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0702  fatty acid hydroxylase  100 
 
 
151 aa  301  2.0000000000000002e-81  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1074  carotene hydroxylase  66.21 
 
 
157 aa  203  5e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2038  beta-carotene hydroxylase  42.4 
 
 
155 aa  103  7e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0223903  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0059  carotene hydroxylase  41.43 
 
 
146 aa  94  7e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0482  fatty acid hydroxylase  39.69 
 
 
153 aa  93.6  8e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4535  carotene hydroxylase  35.14 
 
 
168 aa  90.5  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.179173  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2033  fatty acid hydroxylase  39.84 
 
 
158 aa  88.2  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5618  fatty acid hydroxylase  38.76 
 
 
158 aa  86.3  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1710  fatty acid hydroxylase  37.3 
 
 
157 aa  86.3  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0174617  normal  0.199306 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5702  fatty acid hydroxylase  36 
 
 
158 aa  85.5  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.733403 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1168  carotene hydroxylase  38.97 
 
 
176 aa  85.1  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2128  carotene hydroxylase  37.14 
 
 
200 aa  82.4  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.287054  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2089  fatty acid hydroxylase  41.18 
 
 
152 aa  80.1  0.000000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.213926  normal  0.0390398 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2665  fatty acid hydroxylase  34.48 
 
 
155 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00925  beta carotene hydroxylase  37.21 
 
 
150 aa  71.6  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0820684  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_9013  predicted protein  33.07 
 
 
153 aa  62.4  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0252602  normal  0.0220603 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2647  fatty acid hydroxylase  33.58 
 
 
176 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.810487  normal  0.467325 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3246  beta-carotene hydroxylase  31.97 
 
 
155 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2516  carotene hydroxylase  31.97 
 
 
155 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>