27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4418 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4418  hypothetical protein  100 
 
 		 65 aa  131  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4810  formate dehydrogenase region TAT target  90.77 
 
 		 65 aa  121  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.202852 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4130  formate dehydrogenase region TAT target  81.25 
 
 		 65 aa  110  6e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0062  hypothetical protein  81.54 
 
 		 65 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4134  formate dehydrogenase region TAT target  78.12 
 
 		 65 aa  107  6e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0230  formate dehydrogenase region TAT target  69.7 
 
 		 66 aa  91.3  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.202106 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4227  formate dehydrogenase region TAT target  69.7 
 
 		 66 aa  91.3  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210413 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4139  hypothetical protein  69.7 
 
 		 66 aa  91.3  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3723  twin-arginine translocation pathway signal  69.7 
 
 		 66 aa  89.4  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3794  twin-arginine translocation pathway signal  69.7 
 
 		 66 aa  89.4  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3919  hypothetical protein  69.7 
 
 		 66 aa  89.4  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.768927 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4109  formate dehydrogenase region TAT target  68.18 
 
 		 66 aa  89.4  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0334  twin-arginine translocation pathway signal  65.15 
 
 		 66 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4512  hypothetical protein  69.7 
 
 		 66 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4422  twin-arginine translocation pathway signal  49.23 
 
 		 66 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4814  formate dehydrogenase region TAT target  52.31 
 
 		 65 aa  53.5  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.668008 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0058  twin-arginine translocation pathway signal  52.31 
 
 		 66 aa  52.4  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3610  hypothetical protein  40.62 
 
 		 64 aa  47.4  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1452  hypothetical protein  40.54 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1121  hypothetical protein  48.53 
 
 		 65 aa  45.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4138  formate dehydrogenase region TAT target  49.23 
 
 		 66 aa  45.1  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0338  hypothetical protein  44.62 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0056  twin-arginine translocation pathway signal  44.44 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3719  twin-arginine translocation pathway signal  42.86 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4508  hypothetical protein  46.03 
 
 		 65 aa  41.6  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3915  hypothetical protein  46.03 
 
 		 65 aa  41.6  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3790  twin-arginine translocation pathway signal  41.43 
 
 		 65 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.973838  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>