15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3798 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3798  hypothetical protein  100 
 
 		 514 aa  1046    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0661143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0785  peptidase S41  43.03 
 
 		 485 aa  412  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000105826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0925  hypothetical protein  34.54 
 
 		 520 aa  310  5.9999999999999995e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0959  hypothetical protein  34.54 
 
 		 520 aa  310  5.9999999999999995e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.628982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3411  hypothetical protein  34.86 
 
 		 518 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0951  hypothetical protein  35.35 
 
 		 520 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3046  peptidase S41  34.12 
 
 		 521 aa  295  1e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.854306  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3731  hypothetical protein  34.73 
 
 		 515 aa  293  4e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3075  hypothetical protein  33.52 
 
 		 515 aa  292  9e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0733836  normal  0.924157 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0860  hypothetical protein  34.79 
 
 		 515 aa  290  4e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.258003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0897  hypothetical protein  33.91 
 
 		 515 aa  288  1e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0670  hypothetical protein  33.74 
 
 		 488 aa  282  8.000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000436312 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2894  hypothetical protein  34.39 
 
 		 547 aa  262  1e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.198143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0660  hypothetical protein  26.24 
 
 		 498 aa  181  4e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0871  peptidase S41  36.11 
 
 		 300 aa  45.4  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.736604 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>