45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1816 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_1816  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
304 aa  639    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1575  GNAT family L-lysine 2,3-aminomutase/acetyltransferase  43.24 
 
 
311 aa  224  1e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0338041 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1651  GCN5-related N-acetyltransferase  43.64 
 
 
278 aa  224  2e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.226179 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1907  GCN5-related N-acetyltransferase  41 
 
 
300 aa  221  9.999999999999999e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000360811  hitchhiker  0.000663525 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1080  GCN5-related N-acetyltransferase  40.88 
 
 
296 aa  218  8.999999999999998e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1402  GNAT family acetyltransferase  45.14 
 
 
278 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346646  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0273  GCN5-related N-acetyltransferase  39.06 
 
 
279 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0695  GCN5-related N-acetyltransferase  41.36 
 
 
278 aa  212  5.999999999999999e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000786143  normal  0.226347 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0210  GCN5-related N-acetyltransferase  41.16 
 
 
282 aa  208  7e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0800  GCN5-related N-acetyltransferase  39 
 
 
279 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0188  hypothetical protein  41.2 
 
 
298 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0241  GCN5-related N-acetyltransferase  35.69 
 
 
276 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.975247  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0133  L-lysine 2,3-aminomutase  38.93 
 
 
730 aa  187  2e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0216  GCN5-related N-acetyltransferase  36.27 
 
 
279 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.81013  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_197  L-lysine 2,3-aminomutase/beta-lysine acetyltransferase, GNAT family  39.26 
 
 
730 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0221  GNAT family L-lysine 2,3-aminomutase/acetyltransferase  38.59 
 
 
708 aa  181  1e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.893806  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0344  CoB--CoM heterodisulfide reductase  33.67 
 
 
279 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0017728  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1794  GCN5-related N-acetyltransferase  32.21 
 
 
277 aa  154  1e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.612942  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0667  GCN5-related N-acetyltransferase  31.88 
 
 
274 aa  152  8e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.513634  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0107  GCN5-related N-acetyltransferase  31.12 
 
 
274 aa  152  8.999999999999999e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.14139 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1222  GCN5-related N-acetyltransferase  31.72 
 
 
276 aa  145  6e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.682758  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0671  acetyltransferase (GNAT) family protein  30.46 
 
 
325 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.582205 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0170  GCN5-related N-acetyltransferase  30.43 
 
 
284 aa  140  3e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.636018  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0601  GCN5-related N-acetyltransferase  33.59 
 
 
296 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.532413  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2332  acetyltransferase  31.52 
 
 
281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0431348  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2406  acetyltransferase, GNAT family  31.52 
 
 
281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2298  acetyltransferase  31.52 
 
 
281 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2143  acetyltransferase  31.52 
 
 
281 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.126665  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2323  acetyltransferase, GNAT family  31.52 
 
 
281 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2077  acetyltransferase  31.52 
 
 
281 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2081  acetyltransferase  31.52 
 
 
281 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2116  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 
299 aa  124  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0869765  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2279  beta-lysine acetyltransferase  31.25 
 
 
299 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3044  beta-lysine acetyltransferase  31.25 
 
 
299 aa  122  6e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.623398  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1686  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 
284 aa  122  7e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.32598  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0739  GCN5-related N-acetyltransferase  29.43 
 
 
282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3127  GCN5-related N-acetyltransferase  26.19 
 
 
306 aa  94  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5033  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.77 
 
 
147 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.708408  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0281  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.56 
 
 
147 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0286  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.56 
 
 
147 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0291  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  25.78 
 
 
147 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0664508  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0310  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.56 
 
 
147 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0232  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  26.56 
 
 
147 aa  43.5  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3786  FR47 domain protein  27.15 
 
 
224 aa  43.1  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00741152  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4353  GCN5-related N-acetyltransferase  34.25 
 
 
241 aa  42.7  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.734146  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>