28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1767 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1767  hypothetical protein  100 
 
 		 347 aa  709    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1704  hypothetical protein  27.89 
 
 		 337 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1225  hypothetical protein  27.89 
 
 		 337 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939145  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1120  hypothetical protein  28.72 
 
 		 337 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1676  hypothetical protein  27.21 
 
 		 337 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.617002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1131  hypothetical protein  27.93 
 
 		 337 aa  106  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.238037 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3423  hypothetical protein  26.01 
 
 		 350 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2799  hypothetical protein  26.26 
 
 		 333 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1032  hypothetical protein  24.91 
 
 		 348 aa  61.6  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.266307 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6008  hypothetical protein  26.27 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0903949  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2666  hypothetical protein  26.09 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1066  hypothetical protein  26.3 
 
 		 354 aa  59.3  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2137  hypothetical protein  25 
 
 		 333 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2750  hypothetical protein  25 
 
 		 333 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0649  hypothetical protein  25.45 
 
 		 340 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.641488  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2217  hypothetical protein  25 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.685913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5981  hypothetical protein  23.71 
 
 		 337 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.589392  normal  0.48413 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2775  hypothetical protein  27.31 
 
 		 333 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1407  hypothetical protein  26.3 
 
 		 326 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.54896  normal  0.251254 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0663  hypothetical protein  25.09 
 
 		 340 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0825  hypothetical protein  25.09 
 
 		 340 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2895  hypothetical protein  25.09 
 
 		 340 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2190  hypothetical protein  25.09 
 
 		 340 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2517  hypothetical protein  25.09 
 
 		 340 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0049  hypothetical protein  25.09 
 
 		 299 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0020  hypothetical protein  24.75 
 
 		 315 aa  54.3  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.315274 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0973  hypothetical protein  26.82 
 
 		 330 aa  52.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00869444 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0549  hypothetical protein  24.92 
 
 		 333 aa  49.3  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>