17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1755 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1755  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  400  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.196459  normal  0.218269 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2832  hypothetical protein  70.83 
 
 		 194 aa  302  2.0000000000000002e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00830995 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1519  hypothetical protein  65.79 
 
 		 199 aa  277  8e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000380714  normal  0.0491707 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2854  hypothetical protein  64.58 
 
 		 199 aa  276  1e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1586  hypothetical protein  65.26 
 
 		 199 aa  276  1e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.196957  normal  0.0760005 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1580  hypothetical protein  64.21 
 
 		 199 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.530554  normal  0.0781928 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2635  hypothetical protein  62.69 
 
 		 198 aa  266  2e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.895876  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2749  hypothetical protein  62.18 
 
 		 198 aa  265  2e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.188485  normal  0.0271892 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2670  hypothetical protein  61.66 
 
 		 198 aa  265  4e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1714  hypothetical protein  62.18 
 
 		 198 aa  264  5e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0456721  hitchhiker  0.000000514861 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2367  hypothetical protein  61.46 
 
 		 196 aa  260  1e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.406853  normal  0.0535079 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1699  hypothetical protein  59.38 
 
 		 193 aa  241  3.9999999999999997e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1526  hypothetical protein  50.52 
 
 		 196 aa  190  9e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0874  hypothetical protein  29.82 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00470179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0006  hypothetical protein  31.36 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4581  hypothetical protein  31.25 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001840  hypothetical protein  35.14 
 
 		 115 aa  52.4  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>