38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1663 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1663  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  340  4e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.601886  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3047  hypothetical protein  75.29 
 
 		 163 aa  266  1e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1441  hypothetical protein  80.79 
 
 		 163 aa  264  4e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1506  hypothetical protein  80.79 
 
 		 163 aa  264  4e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1498  hypothetical protein  80.79 
 
 		 163 aa  264  4e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2745  hypothetical protein  74.71 
 
 		 163 aa  264  5e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0400894  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1631  protein of unknown function DUF1097  74.12 
 
 		 163 aa  263  1e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0765083  hitchhiker  0.000320926 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2821  hypothetical protein  74.12 
 
 		 163 aa  263  1e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.105044  normal  0.367538 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2423  hypothetical protein  78.81 
 
 		 163 aa  256  1e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2948  hypothetical protein  68.24 
 
 		 170 aa  249  1e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.733688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2264  hypothetical protein  74 
 
 		 164 aa  241  3.9999999999999997e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00650617  normal  0.090573 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2728  hypothetical protein  82.84 
 
 		 134 aa  239  1e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000943165  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1636  hypothetical protein  73.33 
 
 		 162 aa  229  1e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3548  hypothetical protein  64.49 
 
 		 163 aa  187  5.999999999999999e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2222  hypothetical protein  57.93 
 
 		 175 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.118265  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2141  hypothetical protein  51.97 
 
 		 154 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.978613 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0476  hypothetical protein  43.07 
 
 		 170 aa  121  6e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000160273  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1234  inner membrane protein YcdZ  43.75 
 
 		 164 aa  120  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.698042  normal  0.958349 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05920  hypothetical protein  45.04 
 
 		 206 aa  120  7e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0051  inner membrane protein  47.33 
 
 		 166 aa  120  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0519203  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2052  inner membrane protein YcdZ  43.4 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.151738  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1204  inner membrane protein YcdZ  43.12 
 
 		 170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.541907  normal  0.537174 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2235  inner membrane protein YcdZ  43.4 
 
 		 170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.800715 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1249  hypothetical protein  43.4 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.540058 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000191  hypothetical protein  43.07 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0212289  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2609  protein of unknown function DUF1097  46.62 
 
 		 173 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00104485  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01040  hypothetical protein  46.62 
 
 		 163 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2293  hypothetical protein  46.62 
 
 		 163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.271062  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2097  hypothetical protein  46.62 
 
 		 173 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2563  hypothetical protein  46.62 
 
 		 173 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.232461 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1154  hypothetical protein  46.62 
 
 		 163 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.308865  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01033  predicted inner membrane protein  46.62 
 
 		 163 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1155  hypothetical protein  45.86 
 
 		 163 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1552  hypothetical protein  44.36 
 
 		 174 aa  114  5e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.215305  normal  0.0993887 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1415  hypothetical protein  45.86 
 
 		 163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0524852 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3290  hypothetical protein  43.88 
 
 		 164 aa  104  7e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1285  hypothetical protein  37.21 
 
 		 150 aa  92  4e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0686848  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1496  hypothetical protein  37.21 
 
 		 150 aa  91.7  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00154693  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>