55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1331 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1331  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  431  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.131922 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3324  hypothetical protein  89.76 
 
 		 205 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109882 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1210  hypothetical protein  88.78 
 
 		 205 aa  390  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1229  hypothetical protein  85.37 
 
 		 205 aa  377  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3060  hypothetical protein  85.71 
 
 		 205 aa  373  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2978  hypothetical protein  85.22 
 
 		 205 aa  371  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.294635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3158  hypothetical protein  85.64 
 
 		 205 aa  370  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1074  hypothetical protein  82.84 
 
 		 205 aa  365  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1033  hypothetical protein  83.33 
 
 		 217 aa  363  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.935593  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1134  hypothetical protein  82.84 
 
 		 217 aa  362  2e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3258  hypothetical protein  82.84 
 
 		 217 aa  362  2e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.077733 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1100  hypothetical protein  82.84 
 
 		 217 aa  362  2e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3557  hypothetical protein  82.18 
 
 		 205 aa  358  2e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1038  hypothetical protein  80 
 
 		 205 aa  356  9.999999999999999e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1060  hypothetical protein  82.35 
 
 		 203 aa  342  2e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1221  hypothetical protein  82.89 
 
 		 228 aa  342  2.9999999999999997e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3372  putative lipoprotein  69.61 
 
 		 204 aa  293  9e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4077  putative lipoprotein  66 
 
 		 206 aa  290  1e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.364574  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1367  putative lipoprotein  61.76 
 
 		 218 aa  268  2.9999999999999997e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02762  putative lipoprotein  60.89 
 
 		 212 aa  257  7e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0691373  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3012  transcriptional regulatory protein  57.61 
 
 		 198 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2633  hypothetical protein  55.38 
 
 		 206 aa  221  4e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03485  hypothetical protein  51.61 
 
 		 187 aa  213  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002531  hypothetical protein  51.32 
 
 		 188 aa  212  2.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0644  putative lipoprotein  48.74 
 
 		 199 aa  198  3.9999999999999996e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1944  hypothetical protein  46.63 
 
 		 215 aa  191  7e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0808013  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0147  hypothetical protein  46.56 
 
 		 193 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.126883 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1496  hypothetical protein  46.56 
 
 		 193 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2668  hypothetical protein  45.79 
 
 		 192 aa  185  4e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0580276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3447  putative lipoprotein  46.74 
 
 		 197 aa  185  4e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.002618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2902  hypothetical protein  46.03 
 
 		 193 aa  184  9e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.40239 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1365  hypothetical protein  44 
 
 		 198 aa  181  6e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1361  hypothetical protein  43.5 
 
 		 198 aa  179  2e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0062  hypothetical protein  47.43 
 
 		 195 aa  176  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0191236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0430  putative lipoprotein  41.67 
 
 		 192 aa  172  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1882  transcriptional regulatory protein  48.72 
 
 		 204 aa  171  5e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.622701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0068  lipoprotein  44.79 
 
 		 194 aa  169  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291944 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2230  hypothetical protein  40.4 
 
 		 210 aa  169  2e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2832  transcriptional regulatory protein  40.91 
 
 		 231 aa  167  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000741342  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0984  hypothetical protein  39.33 
 
 		 218 aa  161  5.0000000000000005e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00101229  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2173  hypothetical protein  40.22 
 
 		 234 aa  160  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0780723  normal  0.253338 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0710  putative lipoprotein  39.43 
 
 		 189 aa  154  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.147777  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0234  hypothetical protein  42.27 
 
 		 193 aa  148  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0204  hypothetical protein  42.27 
 
 		 193 aa  147  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1317  putative lipoprotein  38.5 
 
 		 196 aa  147  9e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2885  hypothetical protein  37.19 
 
 		 209 aa  145  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0501836  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1048  hypothetical protein  38.25 
 
 		 248 aa  145  5e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1984  lytic transglycosylase catalytic  40.1 
 
 		 194 aa  144  6e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0021  hypothetical protein  39.04 
 
 		 212 aa  144  1e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1168  putative lipoprotein  41.27 
 
 		 194 aa  141  6e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0748418  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1205  putative lipoprotein  41.44 
 
 		 194 aa  141  6e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2157  hypothetical protein  38.5 
 
 		 212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.563893  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3587  hypothetical protein  41.48 
 
 		 194 aa  134  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.503233  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1881  hypothetical protein  39.55 
 
 		 190 aa  131  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2221  putative transmembrane protein  38.89 
 
 		 189 aa  128  8.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.860046  normal  0.348957 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>