22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9378 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_9378  hypothetical protein  100 
 
 		 206 aa  415  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.744975  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3580  hypothetical protein  90.29 
 
 		 205 aa  379  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4974  hypothetical protein  84.95 
 
 		 205 aa  353  8.999999999999999e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5100  hypothetical protein  74.29 
 
 		 221 aa  323  8.000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.333  hitchhiker  0.000000366045 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4582  hypothetical protein  71.9 
 
 		 218 aa  313  9.999999999999999e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.466428  hitchhiker  0.0015101 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7331  hypothetical protein  74.27 
 
 		 212 aa  311  3.9999999999999997e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4539  hypothetical protein  74.27 
 
 		 212 aa  309  2e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2151  GCN5-related N-acetyltransferase  72.2 
 
 		 230 aa  306  1.0000000000000001e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7089  hypothetical protein  64.11 
 
 		 210 aa  265  2.9999999999999995e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.670641  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4505  hypothetical protein  61.72 
 
 		 244 aa  242  1.9999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0109204 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39700  acetyltransferase (GNAT) family protein  60 
 
 		 207 aa  237  9e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6428  GCN5-related N-acetyltransferase  55.39 
 
 		 204 aa  219  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4689  GCN5-related N-acetyltransferase  53.03 
 
 		 224 aa  214  5e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.969792  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5404  hypothetical protein  44.2 
 
 		 269 aa  180  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13951  hypothetical protein  42.67 
 
 		 244 aa  172  5e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5781  hypothetical protein  42.44 
 
 		 249 aa  170  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.448544  normal  0.0206259 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5494  hypothetical protein  42.44 
 
 		 249 aa  170  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0743345  normal  0.20283 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5405  hypothetical protein  42.44 
 
 		 249 aa  170  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0836  hypothetical protein  41.32 
 
 		 249 aa  169  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.485389 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6070  hypothetical protein  41.84 
 
 		 246 aa  167  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.790458  normal  0.16061 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4235  hypothetical protein  43.36 
 
 		 239 aa  156  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4856  hypothetical protein  36.1 
 
 		 261 aa  137  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>