14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9127 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_9127  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  340  5.999999999999999e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86878  normal  0.851939 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2475  VanZ family protein  49.73 
 
 		 186 aa  125  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3303  VanZ family protein  43.85 
 
 		 188 aa  115  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.68959  normal  0.973248 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4512  VanZ family protein  48.62 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.107268  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2373  VanZ family protein  33.03 
 
 		 156 aa  53.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.521595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3806  VanZ family protein  25.27 
 
 		 172 aa  52.4  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3291  VanZ family protein  24.32 
 
 		 116 aa  47.8  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00099005  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2262  VanZ family protein  37.74 
 
 		 150 aa  44.7  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.452055  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2684  vanZ protein, putative  24.53 
 
 		 210 aa  44.7  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0413993  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1841  VanZ family protein  27.66 
 
 		 173 aa  43.1  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.329672  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2396  teicoplanin resistance protein  28.57 
 
 		 210 aa  42  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0490  VanZ family protein  34.78 
 
 		 242 aa  41.2  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00564626 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0904  hypothetical protein  32.91 
 
 		 212 aa  40.8  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0962  hypothetical protein  32.91 
 
 		 206 aa  40.8  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>