13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6503 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6503  WalW protein  100 
 
 		 334 aa  693    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4831  WalW protein  49.84 
 
 		 318 aa  328  1.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.608303  hitchhiker  0.0000430577 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3081  hypothetical protein  47.66 
 
 		 336 aa  300  2e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1349  hypothetical protein  27.18 
 
 		 336 aa  101  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.646155  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01305  WalW protein  30.57 
 
 		 333 aa  92.8  7e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1286  glycosyl transferase, group 1  25.98 
 
 		 340 aa  91.3  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1196  hypothetical protein  23.32 
 
 		 335 aa  89.4  7e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2250  hypothetical protein  28.3 
 
 		 311 aa  86.7  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.741825 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  30.32 
 
 		 770 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1802  hypothetical protein  23.03 
 
 		 346 aa  83.6  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2057  hypothetical protein  25.73 
 
 		 341 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.100881  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3309  hypothetical protein  25.86 
 
 		 338 aa  68.2  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1397  hypothetical protein  25.61 
 
 		 337 aa  66.6  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.237722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>