18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5538 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5538  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  574  1.0000000000000001e-163  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.590974 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4058  hypothetical protein  56.21 
 
 		 300 aa  311  1e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.57561 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1802  hypothetical protein  58.66 
 
 		 291 aa  301  1e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.354933 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1366  putative aldolase  58.58 
 
 		 316 aa  295  6e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5564  hypothetical protein  60.16 
 
 		 293 aa  288  6e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0938  hypothetical protein  59.29 
 
 		 311 aa  285  5e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4490  hypothetical protein  59.57 
 
 		 407 aa  282  5.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.36205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2743  hypothetical protein  53.87 
 
 		 312 aa  282  5.000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.428607  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0661  hypothetical protein  61.59 
 
 		 287 aa  276  2e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228101  normal  0.619548 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2601  hypothetical protein  53 
 
 		 294 aa  276  3e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.913238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3606  hypothetical protein  55.28 
 
 		 309 aa  276  4e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.36156  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3077  hypothetical protein  58.06 
 
 		 295 aa  275  6e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0821  hypothetical protein  60.47 
 
 		 328 aa  275  9e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.298014  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8493  hypothetical protein  57.56 
 
 		 331 aa  272  5.000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397091  normal  0.419584 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4541  hypothetical protein  58.3 
 
 		 311 aa  268  7e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0726  hypothetical protein  52.33 
 
 		 289 aa  267  1e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4017  hypothetical protein  52.6 
 
 		 294 aa  255  5e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2084 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5632  hypothetical protein  49.63 
 
 		 304 aa  232  5e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0797632  normal  0.331611 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>