12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4223 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4223  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  249  7e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.279869  hitchhiker  0.00388236 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17390  protein of unknown function (DU1801)  44.25 
 
 		 117 aa  85.9  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0530083 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0447  hypothetical protein  39.45 
 
 		 113 aa  70.5  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.215277 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2625  hypothetical protein  36.47 
 
 		 109 aa  50.4  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.939105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1586  hypothetical protein  36.51 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2410  hypothetical protein  25.66 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.851277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0288  hypothetical protein  32.29 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0970  hypothetical protein  30.38 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04525  leucyl-tRNA synthetase  25.25 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1803  hypothetical protein  28.81 
 
 		 133 aa  40.8  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.986795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4979  Domain of unknown function DUF1801  29.46 
 
 		 124 aa  40.4  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2457  hypothetical protein  33.33 
 
 		 119 aa  40  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0662521  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>