19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2339 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2339  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  226  6e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3672  hypothetical protein  57.94 
 
 		 112 aa  135  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0775  hypothetical protein  57.14 
 
 		 112 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1233  hypothetical protein  57.94 
 
 		 112 aa  133  8e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.921092  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2259  hypothetical protein  41.96 
 
 		 119 aa  91.3  4e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000118561  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0041  hypothetical protein  39.25 
 
 		 113 aa  86.7  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00636964  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1158  hypothetical protein  40.62 
 
 		 111 aa  85.1  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1556  hypothetical protein  37.5 
 
 		 108 aa  75.1  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0800  hypothetical protein  35.51 
 
 		 155 aa  73.9  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2654  hypothetical protein  36.27 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2683  hypothetical protein  29.63 
 
 		 109 aa  57  0.00000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.828322  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3361  hypothetical protein  30.3 
 
 		 112 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00221996  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39620  hypothetical protein  28.71 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.8273 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1081  hypothetical protein  26.21 
 
 		 115 aa  47.4  0.00007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00650626  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0753  hypothetical protein  31.53 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1478  hypothetical protein  30.63 
 
 		 112 aa  43.9  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1201  hypothetical protein  31.53 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.240997  normal  0.738905 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1724  Protein of unknown function DUF2149  32.98 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125072  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4503  Protein of unknown function DUF2149  34.29 
 
 		 120 aa  40.8  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.426307  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>