27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2338 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2338  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 		 204 aa  419  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0776  biopolymer transport protein-like protein  42.08 
 
 		 198 aa  159  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1234  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.71 
 
 		 197 aa  157  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3673  biopolymer transport protein-like protein  40.57 
 
 		 198 aa  150  8.999999999999999e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0042  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.66 
 
 		 206 aa  90.5  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.122613  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1157  integral membrane protein  28.87 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4504  hypothetical protein  34.78 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.4366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1200  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.41 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.255062  normal  0.76631 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0754  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.17 
 
 		 213 aa  72  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1479  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.82 
 
 		 213 aa  71.6  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2258  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.98 
 
 		 207 aa  71.2  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000178215  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0180  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.23 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.239441  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1725  hypothetical protein  39.08 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.142082  normal  0.485434 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0723  hypothetical protein  26.01 
 
 		 226 aa  66.2  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1640  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.9 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.494463  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0801  integral membrane protein  25.63 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1965  hypothetical protein  28.02 
 
 		 212 aa  61.2  0.000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0117  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.06 
 
 		 145 aa  57.4  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3487  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.86 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1080  integral membrane protein  25.42 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00417975  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2653  hypothetical protein  31.72 
 
 		 158 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0793  hypothetical protein  37.88 
 
 		 147 aa  53.9  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.716115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2684  hypothetical protein  37.5 
 
 		 181 aa  52.8  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.288279  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27470  hypothetical protein  38.81 
 
 		 150 aa  52.4  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0203216  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1555  hypothetical protein  28.57 
 
 		 192 aa  49.7  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3362  hypothetical protein  35.21 
 
 		 158 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00286668  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39630  hypothetical protein  36.62 
 
 		 158 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.854792 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>