20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1176 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1176  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  219  8e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2830  hypothetical protein  90.09 
 
 		 111 aa  180  7e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.616543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3009  hypothetical protein  90.09 
 
 		 111 aa  180  7e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3095  hypothetical protein  88.29 
 
 		 111 aa  178  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.038994 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2912  hypothetical protein  89.19 
 
 		 111 aa  178  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1218  hypothetical protein  88.29 
 
 		 111 aa  178  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1262  hypothetical protein  88.29 
 
 		 111 aa  178  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1295  hypothetical protein  88.29 
 
 		 111 aa  178  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1365  hypothetical protein  86.49 
 
 		 111 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1262  hypothetical protein  54.95 
 
 		 111 aa  124  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000230441 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2748  hypothetical protein  50 
 
 		 111 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.344464  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2914  hypothetical protein  47.75 
 
 		 114 aa  111  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1057  hypothetical protein  44.55 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.455459  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1167  hypothetical protein  54.05 
 
 		 111 aa  100  9e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0897  hypothetical protein  41.75 
 
 		 124 aa  88.2  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.787189 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1071  hypothetical protein  51.35 
 
 		 111 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3220  putative transmembrane protein  32.29 
 
 		 124 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3102  transmembrane protein  31.31 
 
 		 129 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.766019  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2943  hypothetical protein  33.33 
 
 		 124 aa  40  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2873  hypothetical protein  32.29 
 
 		 124 aa  40  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0329049 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>