30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_R0001 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_R0001  tRNA-Sec  100 
 
 		 91 bp  180  4e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0001  tRNA-Sec  93.41 
 
 		 91 bp  133  7.999999999999999e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5031  tRNA-Sec  93.41 
 
 		 95 bp  133  7.999999999999999e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4138  tRNA-Sec  93.41 
 
 		 95 bp  133  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3968  tRNA-Sec  93.41 
 
 		 95 bp  133  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.406998  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3958  tRNA-Sec  93.41 
 
 		 95 bp  133  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4077  tRNA-Sec  93.41 
 
 		 95 bp  133  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.981278 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4031  tRNA-Sec  93.41 
 
 		 95 bp  133  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4001  tRNA-Sec  93.41 
 
 		 95 bp  133  7.999999999999999e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0001  tRNA-Sec  93.41 
 
 		 91 bp  133  7.999999999999999e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.549802 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0001  tRNA-Sec  93.41 
 
 		 91 bp  133  7.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4154  tRNA-Sec  93.41 
 
 		 95 bp  133  7.999999999999999e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.577336  normal  0.0295304 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5080  tRNA-Sec  93.41 
 
 		 91 bp  133  7.999999999999999e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4296  tRNA-Sec  93.41 
 
 		 95 bp  133  7.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00063  tRNA-Sec  93.41 
 
 		 91 bp  133  7.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.964217  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4706  tRNA-Sec  93.41 
 
 		 95 bp  133  7.999999999999999e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4159  tRNA-Sec  92.31 
 
 		 95 bp  125  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0001  tRNA-Sec  87.91 
 
 		 91 bp  93.7  7e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.765077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0005  tRNA-Sec  86.81 
 
 		 91 bp  85.7  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0051  tRNA-Sec  100 
 
 		 92 bp  81.8  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0506501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0006  tRNA-Sec  85.71 
 
 		 91 bp  77.8  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0005  tRNA-Sec  85.71 
 
 		 91 bp  77.8  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t002  tRNA-Sec  85.71 
 
 		 91 bp  77.8  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0005  tRNA-Sec  85.71 
 
 		 91 bp  77.8  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0005  tRNA-Sec  85.71 
 
 		 91 bp  77.8  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3332  selenocysteine-specific translation elongation factor  95.24 
 
 		 2076 bp  67.9  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.665581 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0002  tRNA-Sec  88.06 
 
 		 96 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.114586 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0005  tRNA-Sec  87.32 
 
 		 92 bp  61.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.491433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63460  tRNA-Sec  86.57 
 
 		 92 bp  54  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5525  tRNA-Sec  86.57 
 
 		 96 bp  54  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>