16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4940 on replicon NC_009829
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009829  Spro_4940  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  361  3e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000844553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3592  hypothetical protein  48.03 
 
 		 146 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3389  hypothetical protein  39.37 
 
 		 165 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.248941  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1551  hypothetical protein  40.65 
 
 		 130 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.646726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3107  hypothetical protein  36.77 
 
 		 157 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000543353  decreased coverage  0.0000114562 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0329  hypothetical protein  35.83 
 
 		 130 aa  82.4  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00304499  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3177  hypothetical protein  37.8 
 
 		 146 aa  82  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1518  hypothetical protein  35.22 
 
 		 151 aa  70.5  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00559169 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3017  hypothetical protein  36.11 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.196092  normal  0.052376 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0418  hypothetical protein  30.77 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6261  hypothetical protein  39.51 
 
 		 160 aa  52.4  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1753  hypothetical protein  43.53 
 
 		 149 aa  51.2  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522125  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1938  protein of unknown function DUF437  36.78 
 
 		 172 aa  50.1  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3755  hypothetical protein  34.65 
 
 		 226 aa  45.4  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.473381  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5358  hypothetical protein  35.37 
 
 		 215 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.757362  normal  0.121882 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3920  hypothetical protein  29.2 
 
 		 137 aa  42  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.879955  normal  0.416027 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>