22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4388 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_4388  barstar (barnase inhibitor)  100 
 
 
99 aa  200  4e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0424  barstar  71.26 
 
 
93 aa  107  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1171  barstar  71.26 
 
 
93 aa  107  5e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.011703 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0488  barstar (barnase inhibitor)  71.26 
 
 
93 aa  107  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0467  Barstar (barnase inhibitor)  56.18 
 
 
90 aa  99  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4556  hypothetical protein  56.18 
 
 
90 aa  99  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3428  hypothetical protein  56.18 
 
 
90 aa  99  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3722  hypothetical protein  56.18 
 
 
90 aa  99  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0467  hypothetical protein  56.18 
 
 
90 aa  99  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.295041 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3537  hypothetical protein  56.18 
 
 
90 aa  99  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3535  hypothetical protein  56.18 
 
 
90 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.984313  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03050  hypothetical protein  56.18 
 
 
90 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03099  predicted barnase inhibitor  56.18 
 
 
90 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3626  hypothetical protein  56.18 
 
 
90 aa  97.1  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.276792 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3661  hypothetical protein  56.18 
 
 
90 aa  97.1  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.183785  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3555  barstar  56.18 
 
 
90 aa  97.1  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.559126  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3554  barstar  56.18 
 
 
90 aa  97.1  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3723  hypothetical protein  56.18 
 
 
90 aa  97.1  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.339149 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3675  hypothetical protein  51.65 
 
 
94 aa  93.6  8e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.453371 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1562  Barstar (barnase inhibitor)  37.5 
 
 
95 aa  58.5  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.572166  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2617  hypothetical protein  36.49 
 
 
95 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0122  YrdF  31.65 
 
 
91 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000773419 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>