9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1441 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1441  hypothetical protein  100 
 
 		 62 aa  122  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5530  hypothetical protein  61.9 
 
 		 81 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391178 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0196  hypothetical protein  59.52 
 
 		 76 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.360735  hitchhiker  0.00059571 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0097  hypothetical protein  53.49 
 
 		 101 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5274  hypothetical protein  54.76 
 
 		 107 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.400287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0231  hypothetical protein  54.76 
 
 		 83 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0280  protein of unknown function DUF1127  40.79 
 
 		 76 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.192126  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5184  hypothetical protein  52.38 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281907 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5326  hypothetical protein  55 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0404584 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>