24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1346 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_1346  hypothetical protein  100 
 
 
265 aa  550  1e-156  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0182912  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0945  hypothetical protein  64.84 
 
 
259 aa  341  5.999999999999999e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.333132  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2315  hypothetical protein  58.98 
 
 
259 aa  314  9.999999999999999e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.15037  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2382  hypothetical protein  34.04 
 
 
293 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.956505  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2883  hypothetical protein  32.95 
 
 
310 aa  145  5e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2065  hypothetical protein  35.88 
 
 
280 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.379601  normal  0.945637 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3166  hypothetical protein  32.95 
 
 
298 aa  143  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.578089  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2209  hypothetical protein  35.38 
 
 
280 aa  142  5e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131678  normal  0.543149 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1065  hypothetical protein  32.95 
 
 
289 aa  138  7.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.390948  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26660  hypothetical protein  33.09 
 
 
289 aa  135  6.0000000000000005e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.13842  normal  0.0470074 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5394  hypothetical protein  32.2 
 
 
343 aa  131  9e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1931  hypothetical protein  31.38 
 
 
287 aa  124  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0412826  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43168  predicted protein  26 
 
 
282 aa  84.3  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0764415  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1714  hypothetical protein  30.28 
 
 
254 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1260  hypothetical protein  26.95 
 
 
266 aa  55.5  0.0000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.503524  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3395  2OG-Fe(II) oxygenase  25.95 
 
 
269 aa  45.8  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4124  2OG-Fe(II) oxygenase  25.95 
 
 
269 aa  45.8  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.321981  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4242  2OG-Fe(II) oxygenase  25.95 
 
 
269 aa  45.8  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4468  2OG-Fe(II) oxygenase  22.73 
 
 
269 aa  44.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.342979  normal  0.778625 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4656  hypothetical protein  27.18 
 
 
247 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.756927  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1911  2OG-Fe(II) oxygenase  25.95 
 
 
268 aa  43.9  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.68349 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0689  hypothetical protein  26.71 
 
 
252 aa  43.1  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4019  2OG-Fe(II) oxygenase  22.08 
 
 
269 aa  42.7  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.755461  normal  0.70334 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3538  2OG-Fe(II) oxygenase  22.08 
 
 
269 aa  42.7  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>