20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_4134 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_4134  formate dehydrogenase region TAT target  100 
 
 		 65 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4130  formate dehydrogenase region TAT target  95.38 
 
 		 65 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4810  formate dehydrogenase region TAT target  78.12 
 
 		 65 aa  107  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.202852 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4418  hypothetical protein  78.12 
 
 		 65 aa  107  6e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0062  hypothetical protein  79.69 
 
 		 65 aa  106  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0230  formate dehydrogenase region TAT target  73.44 
 
 		 66 aa  90.5  7e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.202106 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4227  formate dehydrogenase region TAT target  73.44 
 
 		 66 aa  90.5  7e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210413 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4139  hypothetical protein  73.44 
 
 		 66 aa  90.5  7e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4109  formate dehydrogenase region TAT target  71.88 
 
 		 66 aa  88.6  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3919  hypothetical protein  70.31 
 
 		 66 aa  86.7  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.768927 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3794  twin-arginine translocation pathway signal  70.31 
 
 		 66 aa  86.7  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3723  twin-arginine translocation pathway signal  70.31 
 
 		 66 aa  86.7  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0334  twin-arginine translocation pathway signal  67.19 
 
 		 66 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4512  hypothetical protein  70.31 
 
 		 66 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3610  hypothetical protein  45.61 
 
 		 64 aa  53.5  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4422  twin-arginine translocation pathway signal  40.62 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4814  formate dehydrogenase region TAT target  46.15 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.668008 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1452  hypothetical protein  43.94 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0058  twin-arginine translocation pathway signal  43.75 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4138  formate dehydrogenase region TAT target  45.31 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>