26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2318 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2318  hypothetical protein  100 
 
 		 100 aa  204  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2552  hypothetical protein  73 
 
 		 96 aa  159  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3321  hypothetical protein  74.74 
 
 		 96 aa  150  5e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0137  hypothetical protein  75.29 
 
 		 118 aa  140  6e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2221  hypothetical protein  70.83 
 
 		 95 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00323479  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1930  hypothetical protein  64.65 
 
 		 100 aa  134  4e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0856  hypothetical protein  62.89 
 
 		 97 aa  132  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1819  hypothetical protein  61.11 
 
 		 100 aa  130  6e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0698228  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2546  hypothetical protein  67.06 
 
 		 115 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.211724  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4057  hypothetical protein  67.71 
 
 		 96 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003649  hypothetical protein  72.46 
 
 		 69 aa  114  3.9999999999999997e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.13895  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4743  hypothetical protein  55.21 
 
 		 101 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.369246  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1114  hypothetical protein  64.18 
 
 		 74 aa  101  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0954  hypothetical protein  64.18 
 
 		 74 aa  101  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1958  hypothetical protein  53.49 
 
 		 104 aa  99.4  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.781957  normal  0.865529 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2938  protein of unknown function UPF0153  43.02 
 
 		 134 aa  82.8  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0781616  normal  0.823216 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04095  hypothetical protein  37.7 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4386  protein of unknown function UPF0153  34.18 
 
 		 228 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365173  normal  0.783994 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1877  hypothetical protein  39.39 
 
 		 224 aa  42.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10181  Fe-S-cluster oxidoreductase  31.88 
 
 		 115 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0768  protein of unknown function UPF0153  35.38 
 
 		 198 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.932399 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10191  Fe-S-cluster oxidoreductase  30.43 
 
 		 115 aa  41.2  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0950  hypothetical protein  31.88 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1797  protein of unknown function UPF0153  30.12 
 
 		 219 aa  41.2  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.370926  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2539  protein of unknown function UPF0153  32.31 
 
 		 116 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09261  Fe-S-cluster oxidoreductase  33.82 
 
 		 115 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>